Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL13Q9P2N7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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