Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOMER3Q9NSC5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms