Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms