Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRTFDC1Q9NRG1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRTFDC1Q9NRG1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms