Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYLDQ9NQC7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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