Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms