Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3CQ99985 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms