Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD180Q99467 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms