Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms