Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms