Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IL1Q8TBN0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms