Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms