Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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WDR53Q7Z5U6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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WDR53Q7Z5U6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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WDR53Q7Z5U6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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WDR53Q7Z5U6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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WDR53Q7Z5U6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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