Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms