Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC36A4Q6YBV0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms