Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms