Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms