Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM61Q5EBN2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms