Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms