Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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