Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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