Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms