Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms