Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHBQ15464 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHBQ15464 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms