Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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