Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNIP1Q15025 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms