Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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