Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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