Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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CUL3Q13618 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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CUL3Q13618 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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