Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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