Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms