Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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