Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PTPN13Q12923 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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