Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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CHD3Q12873 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHD3Q12873 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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