Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms