Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms