Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNEQ04844 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNEQ04844 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNEQ04844 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms