Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms