Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms