Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms