Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN2Q02246 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms