Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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