Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms