Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLK1P49759 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLK1P49759 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms