Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIP4K2AP48426 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms