Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJB2P29033 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB2P29033 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms