Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms