Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms