Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTGS1P23219 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms