Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms